Trung tâm Y tế thành phố Rạch Giá có trụ sở tại số 02 đường Âu Cơ,  phường Vĩnh Lạc, thành phố Rạch Giá, tỉnh Kiên Giang, được thành lập 07/4/1994 chuyển từ Bệnh viện thị xã Rạch Giá thành Trung tâm Y tế thị xã Rạch Giá, nay được gọi là Trung tâm Y tế thành phố Rạch Giá.

          Đến năm 2018 thực hiện Đề án số 966/ĐA-UBND ngày 25/4/2017 của Ủy ban nhân dân tỉnh về việc tổ chức lại hệ thống tổ chức bộ máy ngành Y tế tỉnh Kiên Giang và Kế hoạch số 1236/KH-SYT ngày 26/7/2017 Triển khai thực hiện Đề án tổ chức lại hệ thống tổ chức bộ máy ngành Y tế tỉnh Kiên Giang của Sở Y tế. Trung tâm Y tế TP Rạch Giá và Trung tâm Dân số - Kế hoạch hóa gia đình thành phố Rạch Giá sáp nhập thành Trung tâm Y tế thành phố Rạch Giá. (Theo Quyết định số 2044/QĐ-TTYT ngày 17/9/2018 của Ủy ban nhân dân tỉnh Kiên Giang về việc thành lập Trung tâm Y tế TP Rạch Giá).

Trung tâm Y tế là đơn vị sự nghiệp có thu trực thuộc Sở Y tế Kiên Giang, chịu sự quản lý toàn diện của Giám đốc Sở Y tế, sự quản lý nhà nước của Ủy ban nhân dân thành phố Rạch Giá và sự chỉ đạo chuyên môn, kỹ thuật của các Trung tâm thuộc hệ dự phòng, các Trung tâm chuyên ngành tuyến tỉnh, đơn vị có tư cách pháp nhân, có trụ sở, có con dấu riêng và được mở tài khoản tại kho bạc Nhà nước. Đơn vị đến nay được xếp bệnh viện hạng 3.

Qua hơn 20 năm thực hiện nhiệm vụ bảo vệ chăm sóc và nâng cao sức khỏe nhân dân trên địa bàn, đơn vị luôn đạt được nhiều thành tích xuất sắc, nhất là công tác Y tế dự phòng đã khống chế không để dịch lớn xảy ra, các chương trình Y tế Quốc gia hàng năm đều đạt trên 97% so với kế hoạch, công tác khám và điều trị tại Y tế cơ sở từng bước ổn định phục vụ nhân dân khá tốt, được nhân dân quý mến.